（一）泄洪以及防洪治理

　　在對河道進行構(gòu)建施工的時候，因為各類建筑物眾多，又不能輕易對其進行排除，就導(dǎo)致了沒有足夠空間來進行河道防洪建設(shè)。不但如此，部分構(gòu)建物因其特殊的位置或獨特的構(gòu)建結(jié)構(gòu)會對河流走勢進行改變，還會造成水流阻雍。這些都造成防洪泄洪的問題，給人民的生命安全造成嚴重威脅。

　　近年來，許多城市存在洪災(zāi)問題，有些由于河道堤防未有達標整治防洪標準不夠高，有些由于不能及時泄洪導(dǎo)致內(nèi)澇，需要綜合考慮防洪排澇功能也是河道治理的難點。

　　（二）無法對自然風(fēng)險進行管控

　　自然環(huán)境是施工人員無法確定的一個因素，所以在進行河道治理時，也成為了一個治理難點。自然風(fēng)險包括水文氣象、作業(yè)環(huán)境等。因為各地環(huán)境不同，所以治理方法也不同，但是自然風(fēng)險具有突發(fā)性，不可抗拒性，所以我們無法從根本上進行治理，只能盡可能做多方面設(shè)想，防治自然風(fēng)險。

　　（三）難以設(shè)計出完全科學(xué)的工程

　　由于每個地方的地質(zhì)有所區(qū)別，每條河流的河勢流路也各不相同，所以很難創(chuàng)造一套能夠通用的科學(xué)工程設(shè)計。另外，河道水流是屬于自然水流，流勢并不穩(wěn)定，沒有辦法進行良好的控制，加上工程配套不齊全、主流控導(dǎo)能力很差、也會造成防洪壓力大、水流散亂等問題。一旦因為工程設(shè)計而出了工程事故，不但危險很大，而且沒有辦法進行及時搶險，會造成大量經(jīng)濟損失。

　　（四）河流污染問題嚴重

　　目前，我國的河流污染嚴重，而且勢態(tài)有不斷加劇的趨勢。雖然河道治理包括對水質(zhì)污染的處理，但是河道治理也沒有辦法短期完全將污染水質(zhì)進行恢復(fù)。而且水污染并不完全是由河道建設(shè)所引起的，其大部分原因還是居民生活污水和工業(yè)污水污染。水資源的污染，不但造成人民生活質(zhì)量下降，還會造成生活用水資源的短缺和工商農(nóng)業(yè)發(fā)展的阻礙，給國家?guī)斫?jīng)濟損失。但是，我國對于生態(tài)環(huán)境的重視程度不夠，一心投入到經(jīng)濟建設(shè)中，忽視了生態(tài)污染對人民生活的影響。導(dǎo)致的結(jié)果是河道難以治理，造成生態(tài)破壞。